El Control Interno es inherente a las funciones que desarrolla Profonanpe como fondo ambiental, por lo que garantizamos la eficiencia y transparencia de nuestros procesos, la confiabilidad de la información que manejamos, el resguardo de los recursos que administramos y la rendición de cuentas, conforme a los estándares internacionales de control interno.
De igual modo, Profonanpe contrata auditorías externas independientes para evaluar su gestión institucional y de los proyectos, donde además de los estados financieros, se verifica el cumplimiento de los contratos y convenios suscritos por la institución. Cabe precisar que, las auditorías externas se llevan a cabo conforme a las Normas Internacionales de Auditoría (ISAs) emitidas por la Federación Internacional de Contadores (IFAC).